Der Verlag wurde am 1. Dezember 1945 von Otto Bauer gegründet. Ziel war die Herausgabe und Verbreitung "guten Evangelischen Schrifttums".
Seit 1981 wurde die Einzelfirma von seinem Sohn Siegfried Bauer weitergeführt. Inzwischen entwickelte sich der Verlag zu einem leistungsfähigen Fachverlag für Arbeitsrecht und Kirchenrecht der Evangelischen Kirche und ihrer Diakonie.
Zu diesem Themenbereich werden auch Fortbildungen und Seminare angeboten.
Seit 1. Dezember 2016 ist der Otto Bauer Verlag eine Marke der Verlagsgruppe Hüthig Jehle Rehm GmbH.